Mission :            

Adapter et mettre en œuvre les techniques de microscopies photoniques dédiées à l’observation d’échantillons d’origine environnementale (échantillons biologiques tels que microorganismes ou cellules, échantillons végétaux, assemblages bio-organo-minéraux…).

Développer de nouvelles méthodologies expérimentales d’imagerie basées sur les instruments d’imagerie quantitative de phase.

Activités :          

– Mettre en œuvre un parc de microscopes comprenant de la microscopie confocale à balayage laser en modes conventionnels (imagerie de fluorescence) ou avancés (imageries multi photons, spectrale, de durée de vie de fluorescence, non linéaire)

– Mettre en œuvre les instruments d’imagerie diffractive de phase en 2D et 3D (caméra de phase et instrument d’holotomographie). Participer au développement des méthodologies expérimentales et de traitement des images de phase

– Assurer un traitement des images et des données spectrales associées

– Former les nouveaux utilisateurs à l’imagerie, les assister dans la conduite des expériences

– Conseiller les utilisateurs sur les préparations d’échantillons, les possibilités techniques et leurs limites, les méthodes d’analyse. Modifier et adapter les protocoles de mesures en fonction des applications des demandeurs

– Assurer la métrologie et le suivi des performances des instruments. Participer à la gestion technique du parc et assurer une veille technologique sur les évolutions en imagerie

– Suivre les démarches de labellisation du plateau instrumental au niveau local (Lorraine Université d’Excellence) et national (REGEF – Réseau géochimique et expérimental français). Déployer et faire appliquer les procédures qualité subséquentes

– Rédiger des documents techniques (rapports, procédures)

Compétences : 

– Compétences approfondies en physique, optique ou systèmes photoniques

– Connaissances générales en microscopie de fluorescence (champ large, confocale à balayage laser) et en microscopie interférentielle

– Faire preuve de rigueur et de méthode

– Capacités à travailler en équipe multidisciplinaire, à communiquer, à transmettre et former

– Capacités d’adaptation et d’organisation – Autonomie

– Langue anglaise : B1 à B2 (cadre européen commun de référence pour les langues)

– Maîtrise de l’outil informatique et des logiciels courants de traitement et d’analyse d’images (par exemple ImageJ, FIJI ou Matlab)

– Des connaissances dans un ou plusieurs domaines de la biologie (microbiologie, biologie végétale, biologie cellulaire) seraient un plus.

Contexte :         

Les activités du LIEC sont dédiées à la compréhension du fonctionnement des écosystèmes perturbés par les activités humaines. Le laboratoire est doté de différents équipements de microscopies optiques et par force atomique qui sont mis en œuvre pour répondre aux travaux de recherche nécessitant des cartographies d’objets inorganiques ou organiques de taille nanométrique (e.g. nanoparticules, molécules) ou micrométrique (e.g. particules d’argiles, cristaux d’hydrocarbures HAP). Ces observations sont à réaliser dans un large panel de matrices biologiques (cellules, tissus, organismes, biofilms) et de matériaux / milieux complexes (eaux naturelles, milieux de cultures, sols, sédiments).

L’agent interviendra sur un parc instrumental qui comprend un microscope confocal à balayage laser permettant différents modes d’imagerie (conventionnelle, durée de vie de fluorescence, multi-photon, non linéaire (SHG-THG)) ainsi que des équipements dédiés à l’imagerie quantitative de phase en 2D ou 3D (holotomographie). Les développements instrumentaux menés sur la plateforme ont pour objectif d’apporter de nouvelles solutions d’imagerie à l’ensemble de la communauté lorraine des géosciences, pour des applications variées en biologie, microbiologie, science des matériaux, sur des échantillons de nature organique et/ou minérale. L’ensemble des équipements d’imagerie est accessible à tous les membres de l’OSU OTELo. Le plateau d’imagerie est intégré dans l’infrastructure de recherche ANATELo portée par OTELo et en voie de labellisation Star LUE (Lorraine Université d’excellence), et fait également partie de l’infrastructure de recherche REGEF.

Les personnels d’appui à la recherche du LIEC sont répartis en 4 pôles de compétences analytiques. L’agent fera partie du pôle de compétences en « Physico-Chimie de l’Environnement ». Ses activités seront à l’interface entre ce pôle et celui de « Biologie Environnementale ». Les activités seront principalement localisées sur les sites de Nancy.

Pour en savoir plus et candidater:  https://profilsdemplois.cnrs.fr/index_public_referens?destination=CE2023 Concours n°115