Les sources hydrothermales profondes sont parmi les écosystèmes microbiens les plus intrigants et les moins étudiés de la planète. Leur étude pourrait offrir des opportunités uniques d’accéder à des connaissances fondamentales sur leur biodiversité et leur dynamique, tout en permettant de mieux comprendre comment la vie étend ses frontières dans les environnements profonds. Afin d’étudier ces systèmes à l’échelle du laboratoire, ce sujet de thèse propose de développer des outils microfluidiques pour (i) réaliser du phénotypage rapide de nouvelles souches isolées dans de larges gammes de pression et de température et (ii) simuler des sources hydrothermales sur puce pour reproduire ces environnements à l’échelle du laboratoire en y intégrant les paramètres thermochimiques, hydrodynamiques, géochimiques et microbiologiques. En couplant ces outils à plusieurs techniques de caractérisation in situ avancées, il s’agira de comprendre comment les micro-organismes vivants dans ces écosystèmes se sont adaptés à ces conditions de pression et de température, et comment ils interagissent entre eux (symbiose) et avec leur environnement.

Compétences souhaitées:

Master ou diplôme d’ingénieur en microbiologie ou génie des bioprocédés. Des compétences en microbiologie des extrémophiles seraient un plus.

Laboratoire d’accueil

ICMCB, UMR5026

87 avenue du docteur Albert Schweitzer, 33607, Pessac Cedex, France

Directeurs de thèse:

Samuel MARRE (samuel.marre@imcb.cnrs.fr)

Anaïs CARIO (anais.cario@icmcb.cnrs.fr)